Juniorprof. Dr. RUTH BRENK
Juniorprofessorin für Medizinische/Pharmazeutische Chemie
Ruth Brenk, 1974 in Jugenheim geboren, studierte von 1994-1998 Pharmazie an der Johannes Gutenberg-Universität Mainz. Nach ihrer Approbation übernahm sie 1999 eine Stelle als wissenschaftliche Mitarbeiterin an der Philips-Universität Marburg und wurde dort auch Mitglied des Graduiertenkollegs "Proteinfunktion auf atomarer Ebene". Mit einer Dissertation zum Thema "Virtuelles Screening, strukturbasiertes Design und Kristallstrukturanalyse von Inhibitoren der tRNA-Guanin Transglykosylase, ein Target der Bakterienruhr" promovierte Brenk 2003 ("summa cum laude") in Marburg. Im Anschluss daran wechselte sie an die University of California, San Francisco (USA), wo sie als Post-Doc, gefördert durch ein Stipendium der Schering Stiftung, zum Thema "Modellbindetaschen für molekulares Design" forschte. Von 2005-2012 war sie als Lecturer an der University of Dundee in Schottland tätig, wo sie ihm Rahmen der "Drug Discovery for neglected Diseases Initiative" die Computer-Chemie-Gruppe aufbaute und leitete.
Zum 1. Dezember 2012 wurde Ruth Brenk zur Juniorprofessorin für Medizinische/Pharmazeutische Chemie am Institut für Pharmazie und Biochemie – Therapeutische Lebenswissenschaften der Johannes Gutenberg-Universität Mainz ernannt. Ziel ihrer Forschung ist es, neue Computermethoden für das strukturbasierte Design von Liganden zu entwickeln sowie basierend auf der Struktur von Proteinen oder RNA neue Liganden zu entwerfen. Eine wichtige Komponente in ihrer Forschung ist das Zusammenspiel von theoretischen und experimentellen Methoden.
Wissenschaftlicher Werdegang
Dezember 2012Ernennung zur Juniorprofessorin für Medizinische/Pharmazeutische Chemie am Institut für Pharmazie und Biochemie – Therapeutische Lebenswissenschaften der Johannes Gutenberg-Universität Mainz
2005-2012
Lecturer an der University of Dundee, Großbritannien
2003-2005
Post-Doc an der University of California, San Francisco, CA, USA
Stipendium der Schering Stiftung
2003
Promotion ("summa cum laude") an der Philips-Universität Marburg
Titel der Dissertation: "Virtuelles Screening, strukturbasiertes Design und Kristallstrukturanalyse von Inhibitoren der tRNA-Guanin Transglykosylase, ein Target der Bakterienruhr"
1999-2003
Wissenschaftliche Mitarbeiterin an der Philips-Universität Marburg
1999-2002
Mitglied des Graduiertenkollegs "Proteinfunktion auf atomarer Ebene" an der Philips-Universität Marburg
1999
Approbation
Pharmaziepraktikantin, Boehringer Ingelheim, Ingelheim
1998-1999
Pharmaziepraktikantin, Bären Apotheke, Mainz
1997-1998
Stipendium des Cusanuswerks
1994-1998
Studium der Pharmazie an der Johannes Gutenberg-Universität Mainz
Forschungsschwerpunkte
- RNA-Ligand-Docking
- Struktur-basiertes Design von Liganden
- Effiziente Navigation im Chemischen Raum
- Analyse von Protein-Bindetaschen
Publikationen (Auswahl)
- Tidten-Luksch N, Grimaldi R, Torrie LS, Frearson JA, Hunter WN, Brenk R. IspE Inhibitors Identified by a Combination of In Silico and In Vitro High-Throughput Screening. PLoS One 7 (4), e35792 (2012).
- Daldrop P, Reyes FE, Robinson DA, Hammond CM, Lilley DM, Batey RT, Brenk R. Novel Ligands for a Purine Riboswitch Discovered by RNA-Ligand Docking. Chem Biol 18 (3), 324-35 (2011).
- Krasowski A, Muthas D, Sarkar A, Schmitt S, Brenk R. DrugPred: A Structure-Based Approach To Predict Protein Druggability Developed Using an Extensive Nonredundant Data Set. J Chem Inf Model 51 (11), 2829-42 (2011).
- Mok NY, Brenk R. Mining the ChEMBL Database: An Efficient Chemoinformatics Workflow for Assembling an Ion Channel-Focused Screening Library. J Chem Inf Model 51 (10), 2449-54 (2011).
- Frearson JA, Brand S, McElroy SP, Cleghorn LA, Smid O, Stojanovski L, Price HP, Guther ML, Torrie LS, Robinson DA, Hallyburton I, Mpamhanga CP, Brannigan JA, Wilkinson AJ, Hodgkinson M, Hui R, Qiu W, Raimi OG, van Aalten DM, Brenk R, Gilbert IH, Read KD, Fairlamb AH, Ferguson MA, Smith DF, Wyatt PG. N-myristoyltransferase inhibitors as new leads to treat sleeping sickness. Nature 464 (7289), 728-32 (2010).
- Mpamhanga CP, Spinks D, Tulloch LB, Shanks EJ, Robinson DA, Collie IT, Fairlamb AH, Wyatt PG, Frearson JA, Hunter WN, Gilbert IH, Brenk R. One Scaffold, Three Binding Modes: Novel and Selective Pteridine Reductase 1 Inhibitors Derived from Fragment Hits Discovered by Virtual Screening. J Med Chem 52 (14), 4454-65 (2009).
- Brenk R, Schipani A, James D, Krasowski A, Gilbert IH, Frearson J, Wyatt PG. Lessons Learnt from Assembling Screening Libraries for Drug Discovery for Neglected Diseases. ChemMedChem 3 (3), 435-444 (2008).
